水吉鎮位于建陽區東部中心，南浦溪中游。地理位置在東經118`14'--118`25'，北緯27`31'--27`30'之間，海拔142米。東部漳坊鎮，西以尤嶺童游鎮銜接。南與小湖鎮毗鄰，北連回龍鄉。土地面積273平方公里，地勢東北高，西南低。地形大部分為低山丘陵。年平均降雨量1700毫米，年平均氣溫在15C--19C之間，氣候春暖夏秋爽，熱盛于寒。