海拉爾農(nóng)牧場管理局作為農(nóng)業(yè)部直屬直供6大墾區(qū)之一，海局受農(nóng)業(yè)部和呼倫貝爾市雙重領(lǐng)導(dǎo)，副廳級建制。作為直屬直供企業(yè)，部分生產(chǎn)物資計劃在農(nóng)業(yè)部單列，每年可從農(nóng)業(yè)部獲得部分貸款和投入。接受自治區(qū)農(nóng)牧場管理局的業(yè)務(wù)領(lǐng)導(dǎo)和呼倫貝爾市的黨政領(lǐng)導(dǎo)。墾區(qū)內(nèi)部實行黨政領(lǐng)導(dǎo)下的分工負責(zé)制。