海原縣國稅局內設10個科室、三個派出機構、一個直屬機構和一個事業單位。派出機構是城區分局、李旺分局、西安稅務所（與城區分局合署辦公）。除李旺分局在工業物流園區辦公外，其他單位和部門都在縣局辦公樓辦公。全局共有干部職工72人，平均年齡40歲。其中，男59人、女13人；漢族50人、回族21人、蒙古族1人；公務員54人、事業人員1人、工勤人員17人。